Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LRRTM2O43300 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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