Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VWA8A3KMH1 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms