Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms