Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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CNTN3Q9P232 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CNTN3Q9P232 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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