Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TRIM69-210ENST00000561043 1017 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 NUS1P4-201ENST00000401550 585 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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