Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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BRD3Q15059 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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BRD3Q15059 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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BRD3Q15059 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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