Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CHD4Q14839 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CHD4Q14839 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHD4Q14839 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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