Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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