Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PTPRGP23470 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms