Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LGALS8-202ENST00000323938 1855 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RN7SKP127-201ENST00000410443 354 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 PIGX-204ENST00000421265 677 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 IGKV3-34-201ENST00000521692 293 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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BCL11BQ9C0K0 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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BCL11BQ9C0K0 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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BCL11BQ9C0K0 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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BCL11BQ9C0K0 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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