Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GTF3C6Q969F1 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GTF3C6Q969F1 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms