Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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ZNF548Q8NEK5 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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