Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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BRD3Q15059 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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BRD3Q15059 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BRD3Q15059 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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