Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ITGA9Q13797 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGA9Q13797 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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