Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM4SF4P48230 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms