Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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USP18Q9UMW8 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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