Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms