Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CCDC85BQ15834 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CCDC85BQ15834 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CCDC85BQ15834 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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CCDC85BQ15834 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC85BQ15834 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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