Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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