Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms