Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CT47B1P0C2W7 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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