Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ERVV-1B6SEH8 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms