Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ATG16L1Q676U5 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ATG16L1Q676U5 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ATG16L1Q676U5 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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ATG16L1Q676U5 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ATG16L1Q676U5 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ATG16L1Q676U5 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ATG16L1Q676U5 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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ATG16L1Q676U5 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ATG16L1Q676U5 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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