Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms