Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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