Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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