Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms