Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
LTV1Q96GA3 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
LTV1Q96GA3 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTV1Q96GA3 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms