Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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ZNF548Q8NEK5 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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