Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TRHDE-201ENST00000261180 10733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 WDFY4-201ENST00000325239 10079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZNF592-203ENST00000560079 8131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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LAMA3Q16787 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SLITRK1-201ENST00000377084 5189 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
LAMA3Q16787 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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