Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
GRIK4Q16099 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms