Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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RAB39AQ14964 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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