Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CUL4AQ13619 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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