Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PTPRGP23470 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms