Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZNF592-201ENST00000299927 7863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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LAMA3Q16787 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LAMA3Q16787 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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