Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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FOXD4Q12950 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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FOXD4Q12950 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FOXD4Q12950 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FOXD4Q12950 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FOXD4Q12950 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FOXD4Q12950 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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FOXD4Q12950 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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FOXD4Q12950 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD4Q12950 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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