Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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CENPFP49454 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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CENPFP49454 ZNF43-202ENST00000357491 5249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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CENPFP49454 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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