Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
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