Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA3Q9Y6Q9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NCOA3Q9Y6Q9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms