Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms