Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP16Q9Y5T5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP16Q9Y5T5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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