Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRBQ9Y5M8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRBQ9Y5M8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms