Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF3AQ9Y496 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF3AQ9Y496 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms