Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL2Q9Y467 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL2Q9Y467 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL2Q9Y467 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL2Q9Y467 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL2Q9Y467 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL2Q9Y467 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms