Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9Y3F1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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