Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM2AQ9Y2K7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM2AQ9Y2K7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms