Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms