Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNNQ9UQP3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms