Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms