Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAK1Q9UPV9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms